L'examen clinique permet de préciser le stade pubertaire – taille et volume (orchidomètre) des testicules, longueur et largeur de la verge, pilosité pubienne et axillaire et déjà d'orienter vers un retard pubertaire simple (plus de 60 % des cas) qui se corrigera spontanément des insuffisances gonadotropes ou gonadiques, permanentes, qui doivent être prises en charge afin de permettre un développement pubertaire complet.